More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0603 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  53.67 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  51.57 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  53.18 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  55.87 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  49.12 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.63 
 
 		 517 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.58 
 
 		 516 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  42.98 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.11 
 
 		 516 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.26 
 
 		 534 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.23 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  38.57 
 
 		 539 aa  157  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.18 
 
 		 526 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.06 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.27 
 
 		 488 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.53 
 
 		 483 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  38.84 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  41.13 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.82 
 
 		 528 aa  151  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 514 aa  151  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  39.56 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.65 
 
 		 480 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.97 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.12 
 
 		 511 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.12 
 
 		 511 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 529 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  41.52 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 251 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.38 
 
 		 527 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.84 
 
 		 705 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  38.94 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  38.96 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  38.94 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  38.05 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  39.39 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>