More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1021 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  46.45 
 
 
223 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  45.33 
 
 
514 aa  185  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  44.65 
 
 
230 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.04 
 
 
228 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.6 
 
 
219 aa  174  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.44 
 
 
244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.84 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.76 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  45.79 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.6 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  42.86 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  44.65 
 
 
219 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  42.38 
 
 
217 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  40.19 
 
 
220 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  39.72 
 
 
220 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.06 
 
 
528 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  40.91 
 
 
234 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  41.67 
 
 
238 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  43.81 
 
 
226 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.52 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  41.86 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.52 
 
 
228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  42.25 
 
 
225 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.08 
 
 
231 aa  165  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.52 
 
 
228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.52 
 
 
228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  44.81 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.6 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.76 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  42.01 
 
 
230 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  39.62 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.81 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.52 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.12 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  39.46 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.93 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.78 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  40 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.48 
 
 
227 aa  161  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  40.48 
 
 
233 aa  161  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  41.43 
 
 
213 aa  161  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.43 
 
 
526 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  39.53 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  41.98 
 
 
215 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  41.47 
 
 
236 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.29 
 
 
228 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  40.28 
 
 
230 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  42.11 
 
 
230 aa  158  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.35 
 
 
517 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  37.62 
 
 
228 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  42.72 
 
 
269 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  38.5 
 
 
229 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.87 
 
 
233 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  37.79 
 
 
228 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  37.61 
 
 
255 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  38.43 
 
 
237 aa  154  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  37.62 
 
 
228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.19 
 
 
232 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.2 
 
 
516 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  37.62 
 
 
228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  37.62 
 
 
228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.78 
 
 
511 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.74 
 
 
516 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  37.5 
 
 
226 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  37.5 
 
 
226 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  42.11 
 
 
232 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.67 
 
 
488 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  37.02 
 
 
230 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.47 
 
 
534 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.78 
 
 
511 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  38.28 
 
 
228 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.9 
 
 
233 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  38.25 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.43 
 
 
667 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.83 
 
 
233 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.18 
 
 
227 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.66 
 
 
252 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  40.09 
 
 
227 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  39.72 
 
 
218 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  38.1 
 
 
228 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  39.45 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  37.8 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  37.8 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  39.62 
 
 
218 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  38.99 
 
 
240 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.35 
 
 
483 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.06 
 
 
220 aa  151  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  41.9 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>