More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5748 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  61.04 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  60 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  58.11 
 
 		 228 aa  258  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  54.5 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  56.11 
 
 		 224 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  53.28 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  51.33 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  55.87 
 
 		 231 aa  228  7e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.49 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  45.61 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.22 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  44 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 514 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.67 
 
 		 517 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.36 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 528 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  42.98 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.15 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.63 
 
 		 488 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.53 
 
 		 510 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 527 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  44.06 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.72 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.44 
 
 		 526 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  37.95 
 
 		 269 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.52 
 
 		 516 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.52 
 
 		 516 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>