More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0578 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl198  putative cytidylate kinase  46.33 
 
 
219 aa  209  4e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0604738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  34.07 
 
 
227 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  36.11 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  32.56 
 
 
223 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  36.92 
 
 
218 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  36.62 
 
 
223 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  34.27 
 
 
223 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  40.19 
 
 
232 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  36.49 
 
 
230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  34.29 
 
 
225 aa  151  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  37.9 
 
 
236 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  39.17 
 
 
226 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  34.39 
 
 
233 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  34.09 
 
 
231 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  32.89 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  35.05 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  33.94 
 
 
514 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  30.66 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  36.67 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  32.86 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  32.38 
 
 
225 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  32.09 
 
 
228 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.04 
 
 
213 aa  143  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  32.58 
 
 
228 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  32.58 
 
 
228 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  32.58 
 
 
228 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.74 
 
 
528 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  30.99 
 
 
252 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  30.77 
 
 
218 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  34.58 
 
 
232 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  33.02 
 
 
232 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  31.39 
 
 
226 aa  142  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  32.7 
 
 
219 aa  141  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  31.98 
 
 
230 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  34.68 
 
 
220 aa  141  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  34.53 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.63 
 
 
526 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  34.55 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  31.58 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  31.58 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  30.45 
 
 
240 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  33.97 
 
 
237 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  29.6 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  34.98 
 
 
219 aa  137  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  34.98 
 
 
219 aa  137  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  32.24 
 
 
231 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  30.14 
 
 
227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  30.14 
 
 
227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  33.79 
 
 
231 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  30.14 
 
 
227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  34.25 
 
 
224 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  30.14 
 
 
227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  30.14 
 
 
227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  30.28 
 
 
229 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  30.56 
 
 
221 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  29.67 
 
 
227 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  33.02 
 
 
237 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  31.25 
 
 
230 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  33.18 
 
 
227 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  35.75 
 
 
230 aa  136  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  33.33 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  31.19 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  30.05 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  29.19 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  31.19 
 
 
225 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  35.02 
 
 
224 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  30.62 
 
 
229 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  27.93 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  35.89 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  31.96 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  31.96 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  31.96 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  28.85 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  31.96 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.46 
 
 
219 aa  134  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  32.02 
 
 
539 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  30.59 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  31.05 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  33.94 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  34.25 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  28.37 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  31.05 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  32.7 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>