More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1496 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  100 
 
 
252 aa  481  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  75.11 
 
 
218 aa  314  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  69.78 
 
 
223 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  62.77 
 
 
231 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  63.93 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  60.63 
 
 
243 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  56.47 
 
 
268 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  55.56 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  56.31 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  60.93 
 
 
225 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  59.19 
 
 
242 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  54.5 
 
 
230 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  59.17 
 
 
226 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  53.33 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  53.33 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  53.33 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  57.21 
 
 
239 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  53.49 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  54.02 
 
 
228 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  50.89 
 
 
244 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.14 
 
 
224 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.9 
 
 
527 aa  188  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  49.13 
 
 
250 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.69 
 
 
230 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  55.36 
 
 
228 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.45 
 
 
528 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48 
 
 
534 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.05 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  51.6 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  58.22 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.15 
 
 
526 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.78 
 
 
228 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.87 
 
 
232 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.05 
 
 
511 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.32 
 
 
539 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.05 
 
 
511 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  47.22 
 
 
223 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 
529 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  42.4 
 
 
225 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.86 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.22 
 
 
231 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.14 
 
 
228 aa  175  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  50.47 
 
 
225 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48 
 
 
480 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.94 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.39 
 
 
240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.55 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  46.4 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.09 
 
 
483 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.26 
 
 
516 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.82 
 
 
225 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.07 
 
 
213 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  49.33 
 
 
248 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.36 
 
 
516 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.62 
 
 
227 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.84 
 
 
221 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  44.19 
 
 
222 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.52 
 
 
517 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.1 
 
 
233 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.5 
 
 
252 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.44 
 
 
219 aa  168  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.67 
 
 
233 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.65 
 
 
218 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  49.78 
 
 
232 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  46.05 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  44.08 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.53 
 
 
224 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.44 
 
 
219 aa  165  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.47 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  46.22 
 
 
755 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  37.1 
 
 
219 aa  164  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 
488 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  41.78 
 
 
514 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.92 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.13 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.99 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.01 
 
 
509 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  48.66 
 
 
228 aa  161  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  40.62 
 
 
225 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.08 
 
 
217 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.57 
 
 
235 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.26 
 
 
232 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  40.43 
 
 
236 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  36.65 
 
 
227 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  44.95 
 
 
218 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  53.95 
 
 
229 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  43.78 
 
 
243 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.2 
 
 
510 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.81 
 
 
220 aa  158  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.26 
 
 
233 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  37.44 
 
 
232 aa  158  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  42.92 
 
 
227 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  43.11 
 
 
223 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  38.39 
 
 
234 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>