More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1271 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  67.84 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  62.61 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  59.55 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  59.65 
 
 		 725 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  53.1 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  56.25 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1536  cytidylate kinase  52.23 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000801215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  46.09 
 
 		 755 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  52.94 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  44.64 
 
 		 709 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  42.37 
 
 		 734 aa  177  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14050  cytidylate kinase  53.3 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  46.05 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  43.61 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  45.85 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  41.05 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.78 
 
 		 526 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 268 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.25 
 
 		 516 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.25 
 
 		 516 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  39.13 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  36.09 
 
 		 213 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.64 
 
 		 511 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 514 aa  132  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.42 
 
 		 528 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.64 
 
 		 511 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  32.6 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  33.63 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.78 
 
 		 534 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  34.36 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  36.77 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.7 
 
 		 517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  32.76 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  36.6 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  32.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  37.38 
 
 		 539 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  40.25 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  37.66 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  36.02 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.2 
 
 		 483 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  29.82 
 
 		 213 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  31.56 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  32.89 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  31.56 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  34.78 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  33.78 
 
 		 510 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  29.91 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  34.62 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  35 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  32.3 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  29.49 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  35.32 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  35.22 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  32.29 
 
 		 509 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  33.19 
 
 		 510 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  34.2 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  33.05 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  34.82 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  27.51 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.62 
 
 		 480 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  31.88 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  33.75 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.69 
 
 		 488 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  34.96 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  34.06 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.54 
 
 		 529 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.32 
 
 		 527 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  34.96 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  34.51 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  34.96 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  38.79 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  31.28 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  34.51 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  34.96 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  34.51 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  34.51 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>