More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2150 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  100 
 
 
246 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  63.09 
 
 
250 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  59.55 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  64.35 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  60.62 
 
 
725 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  57.51 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  51.3 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  50.66 
 
 
755 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  52.65 
 
 
263 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  45.09 
 
 
709 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1536  cytidylate kinase  50 
 
 
237 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000801215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  45.12 
 
 
240 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  44.26 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  39.85 
 
 
734 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  45.89 
 
 
218 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  42.17 
 
 
223 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  38.03 
 
 
232 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  44.07 
 
 
252 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  33.19 
 
 
219 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.32 
 
 
244 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  35.53 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  42.61 
 
 
230 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  37.66 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  37.44 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  38.78 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.39 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14050  cytidylate kinase  51.13 
 
 
243 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  34.8 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  41.18 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  36.29 
 
 
232 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  40.81 
 
 
225 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.22 
 
 
516 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.91 
 
 
539 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.71 
 
 
516 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  40.42 
 
 
237 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  40.09 
 
 
269 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  37.02 
 
 
223 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.07 
 
 
527 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  34.2 
 
 
231 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  34.76 
 
 
224 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  34.2 
 
 
224 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  40.17 
 
 
223 aa  122  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.6 
 
 
534 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  41.53 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  33.63 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  33.63 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.12 
 
 
517 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  34.91 
 
 
227 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  34.05 
 
 
229 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  43.12 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  33.48 
 
 
225 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  42.32 
 
 
226 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.95 
 
 
511 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  41.1 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  41.1 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  41.1 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.95 
 
 
511 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  33.04 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  44.12 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  34.06 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.51 
 
 
480 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.89 
 
 
528 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.46 
 
 
526 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.04 
 
 
529 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  35.44 
 
 
240 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  33.33 
 
 
213 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  35.53 
 
 
228 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  36.25 
 
 
233 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  32.6 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  35.42 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  30.13 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  36.71 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  35.44 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  33.48 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  43.35 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  36.97 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  33.77 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  32.17 
 
 
225 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  38.05 
 
 
252 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  31.78 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  37.02 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  34.53 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.44 
 
 
483 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  32.9 
 
 
233 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  31.78 
 
 
509 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  32.3 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  30.84 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15860  cytidylate kinase  35.44 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  38.39 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  30.67 
 
 
229 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.7 
 
 
488 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  32.9 
 
 
233 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  32.17 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  31.51 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  32.16 
 
 
219 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>