More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0331 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  47.83 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  47.14 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  47.14 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  47 
 
 		 514 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.34 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 214 aa  178  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  45.24 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  41.96 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.73 
 
 		 511 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.73 
 
 		 511 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47.89 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  47.32 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.05 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.02 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.81 
 
 		 526 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.03 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 517 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.02 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.17 
 
 		 529 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  40 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.2 
 
 		 488 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.28 
 
 		 527 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.82 
 
 		 516 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.63 
 
 		 528 aa  161  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>