More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1232 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  63.76 
 
 		 217 aa  276  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  49.31 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  48.85 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  52.58 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  50 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.08 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  49.31 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.43 
 
 		 516 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.43 
 
 		 516 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.02 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47.14 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  47.52 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 229 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.08 
 
 		 528 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.53 
 
 		 527 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 517 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 226 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 226 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.98 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.95 
 
 		 526 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.96 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  40.76 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>