More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1409 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  57.92 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  54.09 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  56.11 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  53.67 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  53.46 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  53 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  53.18 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  51.33 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  47.79 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  46.4 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  48.62 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  48.43 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  46.85 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  45.89 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 		 511 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.44 
 
 		 511 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.33 
 
 		 528 aa  175  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.74 
 
 		 529 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  40.97 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 255 aa  167  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.69 
 
 		 517 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  48.37 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 483 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.92 
 
 		 539 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.36 
 
 		 534 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>