More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2117 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.14 
 
 		 517 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.01 
 
 		 511 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.01 
 
 		 511 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.71 
 
 		 516 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.15 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44 
 
 		 527 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.62 
 
 		 516 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  45 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.6 
 
 		 526 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.45 
 
 		 509 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.1 
 
 		 510 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.3 
 
 		 480 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  45.16 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.88 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.3 
 
 		 483 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.69 
 
 		 488 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  47.22 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.52 
 
 		 510 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.89 
 
 		 528 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  35.48 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  35.68 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 514 aa  155  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.55 
 
 		 509 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>