More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0594 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  100 
 
 
213 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.62 
 
 
226 aa  175  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  44.02 
 
 
219 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.87 
 
 
222 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.44 
 
 
229 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.69 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.54 
 
 
527 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  40.27 
 
 
233 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  41.47 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.3 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.43 
 
 
216 aa  161  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  44.13 
 
 
223 aa  161  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.37 
 
 
233 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.12 
 
 
528 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  41.2 
 
 
225 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.91 
 
 
233 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.34 
 
 
225 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.91 
 
 
231 aa  158  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.86 
 
 
223 aa  157  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.22 
 
 
534 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  42.65 
 
 
225 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  44.65 
 
 
218 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  41.94 
 
 
269 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.08 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.01 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.13 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.43 
 
 
219 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  38.74 
 
 
227 aa  154  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  41.43 
 
 
240 aa  154  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.89 
 
 
516 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  42.18 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.12 
 
 
223 aa  153  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  44.5 
 
 
230 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.37 
 
 
224 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  40.09 
 
 
221 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.18 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.47 
 
 
514 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.78 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  40.65 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.57 
 
 
226 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.44 
 
 
516 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.67 
 
 
244 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  40 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40 
 
 
229 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  41.78 
 
 
218 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  43.89 
 
 
231 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 
526 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.91 
 
 
228 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  43.12 
 
 
268 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.48 
 
 
225 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.01 
 
 
529 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  44.24 
 
 
234 aa  148  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  42.53 
 
 
228 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  42.53 
 
 
228 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  42.53 
 
 
228 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  43.6 
 
 
231 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  44.04 
 
 
228 aa  147  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  37.33 
 
 
232 aa  147  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  39.62 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  35.62 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  42.92 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  42.47 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  44.44 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.15 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  38.36 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.56 
 
 
539 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  38.5 
 
 
227 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40.19 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.66 
 
 
483 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.81 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  36.77 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  37.84 
 
 
217 aa  145  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  40.57 
 
 
226 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  40.57 
 
 
226 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  39.71 
 
 
230 aa  144  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.21 
 
 
517 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  35.87 
 
 
225 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  40.81 
 
 
255 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  42.08 
 
 
237 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  40.37 
 
 
224 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  38.6 
 
 
224 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  37.91 
 
 
221 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  42.86 
 
 
237 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  35.87 
 
 
230 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  35.87 
 
 
230 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  37.05 
 
 
230 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  37.44 
 
 
229 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.84 
 
 
511 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  41.18 
 
 
225 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.79 
 
 
232 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>