More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1293 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  59.72 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  56.6 
 
 		 226 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  55.25 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  57.67 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  54.75 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  53.99 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  57.53 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  53.05 
 
 		 225 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  53.52 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  52.58 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  53.55 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  52.78 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  49.33 
 
 		 539 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  49.08 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  52.27 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.3 
 
 		 534 aa  204  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  50.47 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.03 
 
 		 516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.03 
 
 		 516 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.14 
 
 		 511 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.14 
 
 		 511 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 251 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 250 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.03 
 
 		 510 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  45.78 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.65 
 
 		 528 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  42.86 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.03 
 
 		 510 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.73 
 
 		 509 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 244 aa  177  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.81 
 
 		 526 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.72 
 
 		 527 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 529 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.71 
 
 		 517 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  38.86 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 514 aa  171  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>