More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3589 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  100 
 
 		 233 aa  483  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  63.44 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  61.04 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  54.13 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  49.56 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  53.6 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  53.18 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  53.46 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  51.13 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  46.49 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  46.9 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 238 aa  174  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.65 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.48 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.56 
 
 		 534 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.91 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.91 
 
 		 511 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  38.79 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 539 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.52 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0922  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  39.25 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2258  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.99 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.25 
 
 		 674 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.09 
 
 		 528 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0926  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.47 
 
 		 517 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  37.17 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  34.98 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.93 
 
 		 488 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  39.25 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>