More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1148 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  55.45 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  53.59 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  51.87 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  48.11 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  53.62 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  50 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  48.33 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  47.37 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  46.89 
 
 		 232 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  46.89 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  49.28 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.22 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  46.63 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  47.37 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  46.6 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  53.62 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  47 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  44.93 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.71 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.08 
 
 		 528 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  46.41 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  47.14 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  48.64 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 252 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.18 
 
 		 516 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  47.89 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.5 
 
 		 539 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.15 
 
 		 516 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.7 
 
 		 517 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>