More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1622 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  63.76 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  54.84 
 
 		 220 aa  236  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  54.38 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  51.64 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  48.13 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 233 aa  194  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  47.42 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.87 
 
 		 516 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.41 
 
 		 516 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  47.3 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  43.96 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  46.48 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  44.23 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  44.23 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  44.23 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  44.29 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>