More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0544 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  39.45 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  39.45 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  43.52 
 
 
224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  40.09 
 
 
228 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.45 
 
 
229 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  37.67 
 
 
225 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.47 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.28 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.4 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  39.17 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  38.6 
 
 
232 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.89 
 
 
224 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.64 
 
 
233 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.74 
 
 
233 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  38.43 
 
 
229 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  36.7 
 
 
229 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.07 
 
 
223 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  37.04 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  37.79 
 
 
225 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.61 
 
 
237 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  38.79 
 
 
252 aa  165  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  38.43 
 
 
228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  38.43 
 
 
225 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  38.36 
 
 
230 aa  165  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  38.43 
 
 
228 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  38.39 
 
 
229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  37.73 
 
 
230 aa  164  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  36.57 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  37.9 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  39.9 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  37.44 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  37.44 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  37.79 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  37.44 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  35.81 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  37.44 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  37.26 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  36.62 
 
 
229 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  37.96 
 
 
226 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  42.11 
 
 
218 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  40.2 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  36.24 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.43 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  37.79 
 
 
230 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  36.79 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  37.04 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  36.45 
 
 
228 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.71 
 
 
232 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  33.8 
 
 
244 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  38.28 
 
 
226 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  37.21 
 
 
235 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  37.09 
 
 
214 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  38.91 
 
 
232 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  36.53 
 
 
230 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  35.94 
 
 
225 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  35.94 
 
 
227 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  37.16 
 
 
230 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  35.51 
 
 
229 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  40.87 
 
 
227 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  36.99 
 
 
230 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  36.32 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  35.65 
 
 
227 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.33 
 
 
218 aa  158  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  35.45 
 
 
232 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  35.48 
 
 
229 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  37.96 
 
 
226 aa  157  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  36.62 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  36.62 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.92 
 
 
226 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  39.73 
 
 
213 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  36.92 
 
 
228 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  36.92 
 
 
255 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  37.5 
 
 
219 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  36.92 
 
 
228 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  39.35 
 
 
243 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  39.81 
 
 
230 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  37.62 
 
 
227 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  35.48 
 
 
231 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  36.45 
 
 
228 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  36.45 
 
 
228 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  36.45 
 
 
228 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  36.49 
 
 
251 aa  155  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  36.45 
 
 
228 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  35.19 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>