More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1351 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  49.06 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  47.66 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  47.66 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  46.05 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.05 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  178  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  41.06 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  41.06 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>