More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1180 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  55.45 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  51.66 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  54.21 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  52.27 
 
 		 527 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  47.83 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  50.47 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47.49 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  48.18 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  48.18 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  46.67 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.08 
 
 		 511 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.08 
 
 		 511 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  48.37 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  48.84 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.62 
 
 		 516 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.16 
 
 		 516 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  51.14 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  47.89 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  48.62 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.76 
 
 		 488 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.24 
 
 		 517 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  45.02 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.54 
 
 		 483 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  46.61 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 528 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  52.29 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.69 
 
 		 526 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.12 
 
 		 529 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  44.49 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 		 534 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 539 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 514 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.38 
 
 		 480 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  45.16 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  45.16 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  46.09 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>