More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1515 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  100 
 
 
250 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  96.15 
 
 
251 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  96.15 
 
 
251 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  81.7 
 
 
237 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  51.77 
 
 
240 aa  214  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  53.65 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  52.47 
 
 
233 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  50.67 
 
 
233 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  49.34 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  51.1 
 
 
243 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  48.68 
 
 
232 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.37 
 
 
232 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  47.77 
 
 
222 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.21 
 
 
224 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  47.35 
 
 
233 aa  184  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.44 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.29 
 
 
217 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.59 
 
 
224 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  51.97 
 
 
228 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  44.5 
 
 
237 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  43.5 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  48.58 
 
 
229 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  46.61 
 
 
227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  44.39 
 
 
230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  44.14 
 
 
227 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.52 
 
 
511 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.74 
 
 
219 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.44 
 
 
227 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.52 
 
 
511 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.15 
 
 
229 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  47.53 
 
 
244 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45 
 
 
229 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  44.74 
 
 
230 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.55 
 
 
229 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.5 
 
 
228 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.15 
 
 
229 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  46.58 
 
 
252 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  47.98 
 
 
223 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47.06 
 
 
218 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.67 
 
 
527 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  48.89 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  48.89 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  48.89 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  45.21 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.25 
 
 
514 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  44.13 
 
 
230 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  45.87 
 
 
225 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  44.13 
 
 
230 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  44.13 
 
 
230 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  44.13 
 
 
230 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  43.87 
 
 
226 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.6 
 
 
230 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.78 
 
 
232 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  47.8 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  44.29 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.88 
 
 
480 aa  165  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  39.55 
 
 
219 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  40.93 
 
 
225 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  43.67 
 
 
229 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.65 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  42.22 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  45.07 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  44.39 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.51 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  44.39 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  47.81 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  40.45 
 
 
221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.96 
 
 
539 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  51.1 
 
 
224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  44.39 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.07 
 
 
534 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.4 
 
 
225 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  39.29 
 
 
223 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.79 
 
 
227 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  45.13 
 
 
225 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  38.22 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.5 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.15 
 
 
232 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.35 
 
 
516 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  43.46 
 
 
230 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.98 
 
 
227 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  43.58 
 
 
229 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.69 
 
 
229 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.7 
 
 
221 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.91 
 
 
516 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  49.04 
 
 
228 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  37.56 
 
 
217 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  37.56 
 
 
217 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.3 
 
 
517 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  40.81 
 
 
228 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.13 
 
 
232 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  44.6 
 
 
227 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>