More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1440 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.3 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  46.46 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.98 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  49.33 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.96 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.86 
 
 		 514 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.24 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.24 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.44 
 
 		 526 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.91 
 
 		 516 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  51.8 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  50 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  47.49 
 
 		 268 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.46 
 
 		 516 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.02 
 
 		 488 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.09 
 
 		 528 aa  157  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.44 
 
 		 517 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  43.04 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  47.56 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.98 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.6 
 
 		 534 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  47.03 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.52 
 
 		 539 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.15 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.11 
 
 		 527 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.96 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.64 
 
 		 480 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.82 
 
 		 510 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.38 
 
 		 529 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.05 
 
 		 483 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>