More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0416 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  78.05 
 
 
483 aa  721    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 
480 aa  960    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  64.61 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  55.62 
 
 
517 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.51 
 
 
516 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.1 
 
 
516 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  53.31 
 
 
527 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.61 
 
 
534 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.79 
 
 
511 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.81 
 
 
510 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.83 
 
 
529 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.94 
 
 
526 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.38 
 
 
511 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.9 
 
 
539 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
528 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 
510 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.75 
 
 
509 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.57 
 
 
509 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 
284 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 
283 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 
283 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 
280 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.84 
 
 
287 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 
288 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  47.71 
 
 
294 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.62 
 
 
283 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.09 
 
 
283 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 
283 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.19 
 
 
281 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
280 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  46.55 
 
 
334 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.42 
 
 
289 aa  206  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 
283 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 
280 aa  206  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 
282 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.94 
 
 
282 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.9 
 
 
224 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.08 
 
 
283 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 
280 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 
283 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.66 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  44.27 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.15 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  41.11 
 
 
282 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.33 
 
 
289 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.8 
 
 
283 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.31 
 
 
287 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 
285 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45.21 
 
 
225 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.21 
 
 
225 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  45.85 
 
 
282 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  41.57 
 
 
280 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  43.14 
 
 
287 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
283 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  48.62 
 
 
290 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  43.14 
 
 
287 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  49.8 
 
 
278 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  43.08 
 
 
286 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
285 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  44.44 
 
 
283 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  42.47 
 
 
279 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.75 
 
 
225 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  48.57 
 
 
273 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.06 
 
 
281 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
279 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
285 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
309 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 
282 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.58 
 
 
283 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
285 aa  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.75 
 
 
225 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  43.31 
 
 
281 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  43.25 
 
 
301 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.86 
 
 
225 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  45.74 
 
 
289 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  42.19 
 
 
277 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.27 
 
 
279 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  42.58 
 
 
277 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 
281 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  45.06 
 
 
300 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.95 
 
 
232 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  41.96 
 
 
287 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  41.8 
 
 
268 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.58 
 
 
240 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.44 
 
 
231 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 
279 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  46.29 
 
 
233 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.28 
 
 
286 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 
285 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  49 
 
 
321 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
286 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 
276 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  55.87 
 
 
296 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  41.86 
 
 
283 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>