More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1682 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  86.86 
 
 
510 aa  874    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 
510 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  87.84 
 
 
509 aa  857    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  72.28 
 
 
509 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.52 
 
 
517 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.12 
 
 
516 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.92 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 
483 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.25 
 
 
527 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.36 
 
 
480 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.87 
 
 
488 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.04 
 
 
534 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.93 
 
 
511 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.93 
 
 
511 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.97 
 
 
529 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.83 
 
 
526 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.58 
 
 
539 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.72 
 
 
528 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  48 
 
 
224 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.76 
 
 
228 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  38.55 
 
 
282 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  47.03 
 
 
224 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  47.42 
 
 
231 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1446  pantoate--beta-alanine ligase  37.18 
 
 
278 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1770  pantoate--beta-alanine ligase  37.18 
 
 
278 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.78 
 
 
232 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  47.22 
 
 
225 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  47.22 
 
 
225 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  47.53 
 
 
227 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  47.93 
 
 
213 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  38.16 
 
 
282 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  191  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.25 
 
 
225 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.84 
 
 
225 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  36.97 
 
 
281 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  37.72 
 
 
281 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  37.94 
 
 
286 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  37.46 
 
 
327 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  48.11 
 
 
219 aa  187  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  37.28 
 
 
283 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  45.58 
 
 
223 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  35.74 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 
280 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.58 
 
 
230 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  37.86 
 
 
277 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  36.88 
 
 
286 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  36.1 
 
 
287 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.98 
 
 
226 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.7 
 
 
232 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  37.18 
 
 
298 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.41 
 
 
222 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.2 
 
 
514 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  36.52 
 
 
279 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  36.1 
 
 
287 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  39.27 
 
 
273 aa  182  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  47.11 
 
 
224 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  36.17 
 
 
279 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  38.06 
 
 
281 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  34.6 
 
 
289 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  38.85 
 
 
280 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.02 
 
 
226 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  37.41 
 
 
284 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  36.69 
 
 
334 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0781  pantoate--beta-alanine ligase  37.73 
 
 
257 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  41.52 
 
 
225 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 
285 aa  180  4.999999999999999e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  36.46 
 
 
283 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  39.25 
 
 
280 aa  180  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  37.69 
 
 
284 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.59 
 
 
233 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  37.55 
 
 
282 aa  180  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  37.69 
 
 
284 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  37.36 
 
 
283 aa  179  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  35.59 
 
 
281 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  37.31 
 
 
281 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  38.71 
 
 
277 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  38.33 
 
 
296 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  37.55 
 
 
284 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  36.69 
 
 
283 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  47.6 
 
 
220 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  33.83 
 
 
283 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.75 
 
 
227 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  36.49 
 
 
288 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  38.24 
 
 
283 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  36.69 
 
 
283 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.86 
 
 
229 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  41.94 
 
 
252 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  39.26 
 
 
286 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.01 
 
 
233 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  35.85 
 
 
287 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  37.82 
 
 
282 aa  177  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  42.33 
 
 
232 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  37.94 
 
 
282 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>