More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0781 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0781  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2589  hypothetical protein  46.03 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2716  hypothetical protein  45.63 
 
 
252 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0530  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
257 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1650  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
257 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
287 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
287 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.82 
 
 
280 aa  215  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 
282 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  45.36 
 
 
281 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
280 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
307 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
280 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
283 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 
281 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 
285 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
314 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 
280 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 
283 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
283 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
283 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  38.91 
 
 
282 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
283 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 
280 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
283 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
279 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  43.8 
 
 
284 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  46.3 
 
 
290 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 
283 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  43.97 
 
 
283 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
279 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  46.92 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  46.54 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  46.54 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  45.96 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  43.8 
 
 
290 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 
282 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  40.43 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 
284 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 
278 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 
282 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.65 
 
 
527 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  41.82 
 
 
281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 
281 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
283 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
291 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 
311 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  48.29 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  44.49 
 
 
281 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 
281 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  39.93 
 
 
279 aa  195  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  43.85 
 
 
281 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 
276 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 
281 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  44.81 
 
 
318 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  41.13 
 
 
286 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
282 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 
281 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  41.88 
 
 
281 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 
283 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  42.09 
 
 
277 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
281 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  40.97 
 
 
282 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  39.57 
 
 
280 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 
282 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 
302 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  43.23 
 
 
274 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
290 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  43.08 
 
 
281 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
282 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  43.7 
 
 
285 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  43.02 
 
 
281 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
278 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.09 
 
 
281 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.49 
 
 
289 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
309 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 
282 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  41.55 
 
 
281 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
278 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  44.07 
 
 
285 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  43.22 
 
 
285 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  42.76 
 
 
288 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>