More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0725 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  100 
 
 		 514 aa  1049    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 225 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 225 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 225 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.95 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.85 
 
 		 229 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 216 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 223 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 225 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 232 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.67 
 
 		 223 aa  183  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 218 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.88 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 224 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.5 
 
 		 232 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.58 
 
 		 222 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  47 
 
 		 227 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.34 
 
 		 516 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  48.67 
 
 		 252 aa  180  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.67 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 229 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 227 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 		 516 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 228 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.09 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 232 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 244 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 230 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.39 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 230 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.15 
 
 		 233 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.34 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 224 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 224 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 223 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 232 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.05 
 
 		 529 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 221 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 228 aa  169  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.03 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 214 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 231 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.3 
 
 		 539 aa  169  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 226 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.22 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.22 
 
 		 511 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 240 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  43.5 
 
 		 218 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 233 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 219 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  44.69 
 
 		 251 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 236 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 220 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  44.69 
 
 		 251 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  44.25 
 
 		 250 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 225 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 219 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 223 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 228 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  43.17 
 
 		 269 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 228 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 228 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 234 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 237 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 228 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 255 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.7 
 
 		 526 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 229 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 229 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 217 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  43.48 
 
 		 237 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 229 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 229 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 213 aa  161  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 229 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 233 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 217 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 223 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 234 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  39.92 
 
 		 238 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 228 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 226 aa  158  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 224 aa  158  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.64 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 228 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 225 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>