More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2196 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  52.13 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  52.78 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  49.27 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.53 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.66 
 
 		 511 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.66 
 
 		 511 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.29 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.25 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.05 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.04 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.95 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  41.07 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  35.32 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.74 
 
 		 526 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 529 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 514 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.2 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.44 
 
 		 528 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  39.47 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  36.96 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  36.57 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.52 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.12 
 
 		 516 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.33 
 
 		 527 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.29 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  34.86 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>