More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0909 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  69.41 
 
 		 232 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  63.3 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  54.84 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  52.78 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.81 
 
 		 527 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  34.91 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 511 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 511 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 251 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.34 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.8 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1495  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.89 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.89 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.06 
 
 		 488 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.63 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  34.93 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  44.93 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>