More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2999 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  100 
 
 
218 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  75.8 
 
 
252 aa  293  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  67.89 
 
 
223 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  62.1 
 
 
240 aa  256  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  61.19 
 
 
231 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  55.66 
 
 
268 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  59.55 
 
 
243 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  58.18 
 
 
242 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  52.47 
 
 
255 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  57.41 
 
 
225 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  52.7 
 
 
269 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  55.81 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  57.48 
 
 
226 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  50.67 
 
 
230 aa  188  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  50.44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  51.35 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  51.35 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  51.35 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  55.16 
 
 
239 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.13 
 
 
528 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  50.91 
 
 
228 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.7 
 
 
526 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  56.68 
 
 
227 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  40.91 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  51.56 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.29 
 
 
232 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.5 
 
 
511 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.5 
 
 
511 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.59 
 
 
527 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.84 
 
 
223 aa  168  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.44 
 
 
534 aa  168  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.64 
 
 
539 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  48.17 
 
 
244 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  51.82 
 
 
228 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.26 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  41.94 
 
 
228 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.47 
 
 
221 aa  165  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
483 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.27 
 
 
231 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40.38 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.53 
 
 
529 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.41 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  39.91 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  40.95 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.01 
 
 
517 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  48.39 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
480 aa  161  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.99 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.07 
 
 
225 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.35 
 
 
227 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  39.44 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  48.11 
 
 
225 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  43.06 
 
 
224 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.36 
 
 
516 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  38.97 
 
 
225 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.73 
 
 
232 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.27 
 
 
240 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  40 
 
 
225 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.36 
 
 
219 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.01 
 
 
233 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.71 
 
 
223 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.9 
 
 
516 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  42.08 
 
 
514 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.36 
 
 
226 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  42.92 
 
 
228 aa  155  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.89 
 
 
233 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  41.44 
 
 
220 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 
488 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  41.18 
 
 
223 aa  154  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  45.95 
 
 
755 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  36.89 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  47.39 
 
 
263 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  39.62 
 
 
216 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  41.01 
 
 
217 aa  151  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  34.74 
 
 
213 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  35.35 
 
 
219 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  43.61 
 
 
236 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  38.46 
 
 
224 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.18 
 
 
232 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  41.78 
 
 
213 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.09 
 
 
233 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  38.25 
 
 
219 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.7 
 
 
227 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  44.95 
 
 
248 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  45.89 
 
 
246 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  43.46 
 
 
218 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.05 
 
 
225 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  41.23 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  36.11 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.59 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  37.44 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  39.64 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  38.12 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  44.49 
 
 
237 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  36.82 
 
 
225 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>