More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1536 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1536  cytidylate kinase  83.97 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000801215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  57.33 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  58.99 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  60.71 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  53.1 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  51.3 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  53.81 
 
 		 725 aa  184  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  49.11 
 
 		 755 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  47.17 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  44.16 
 
 		 709 aa  161  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14050  cytidylate kinase  54.79 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  45.71 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  45.81 
 
 		 255 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  39.23 
 
 		 734 aa  148  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.79 
 
 		 539 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.81 
 
 		 534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  36.2 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  41.85 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.63 
 
 		 483 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  36.53 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  35.75 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.15 
 
 		 526 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.58 
 
 		 516 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  44.83 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  36.07 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.66 
 
 		 511 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.2 
 
 		 517 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.58 
 
 		 516 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  35.62 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.66 
 
 		 511 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.63 
 
 		 527 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  36.91 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.48 
 
 		 480 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  39.13 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  42.74 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.9 
 
 		 528 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  47.85 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.24 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  33.49 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  34.58 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  36.73 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.96 
 
 		 488 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.62 
 
 		 529 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  32.89 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  38.16 
 
 		 213 aa  122  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  37.57 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.05 
 
 		 509 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  33.19 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  31.02 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  32.6 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  35.75 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  37.75 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  36.04 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>