More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1926 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  100 
 
 
232 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  75.45 
 
 
250 aa  317  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1271  cytidylate kinase  62.61 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  64.35 
 
 
246 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  66.52 
 
 
725 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  60.71 
 
 
237 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  57.01 
 
 
248 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  61.4 
 
 
263 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1536  cytidylate kinase  61.16 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000801215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  54.95 
 
 
755 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  51.57 
 
 
223 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  51.56 
 
 
218 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  48.29 
 
 
709 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  51.1 
 
 
231 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  46.7 
 
 
240 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  49.78 
 
 
252 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  44.27 
 
 
734 aa  158  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  45.85 
 
 
230 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  48.65 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14050  cytidylate kinase  57.14 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  49.12 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  45.18 
 
 
268 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.34 
 
 
528 aa  141  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  41.85 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.61 
 
 
514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  36.09 
 
 
219 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  44.3 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  42.29 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  46.19 
 
 
226 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  34.63 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.03 
 
 
534 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  36.48 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.07 
 
 
483 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.89 
 
 
480 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.83 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.83 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.83 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.69 
 
 
517 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.78 
 
 
516 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.55 
 
 
539 aa  131  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.49 
 
 
526 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  33.78 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.35 
 
 
516 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  33.33 
 
 
224 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  35.56 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  41.74 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  33.63 
 
 
219 aa  128  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  32.89 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.54 
 
 
228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.79 
 
 
488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  37.33 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  41.26 
 
 
223 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.98 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  39.91 
 
 
225 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  33.63 
 
 
219 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.69 
 
 
527 aa  124  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  32.89 
 
 
221 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  32.9 
 
 
230 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  33.33 
 
 
225 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  46.02 
 
 
239 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.81 
 
 
529 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  33.78 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  36.09 
 
 
233 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  41.88 
 
 
223 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  35.5 
 
 
233 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  42.37 
 
 
237 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  31.14 
 
 
216 aa  121  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  34.33 
 
 
232 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.65 
 
 
511 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.65 
 
 
511 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  32.89 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  37.67 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  41.05 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  36.56 
 
 
229 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  32.44 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  36.05 
 
 
240 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.05 
 
 
222 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  46.76 
 
 
227 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.64 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  38.5 
 
 
216 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  36.77 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  35.4 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  32.75 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  39.38 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  32.31 
 
 
226 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  35.96 
 
 
229 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  30.26 
 
 
225 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  34.51 
 
 
230 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  36 
 
 
228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  31.28 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  36 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  36.56 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  35.68 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>