More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0614 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  100 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  69.61 
 
 		 211 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  61.32 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  66.18 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  60.85 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  59.43 
 
 		 212 aa  227  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  59.15 
 
 		 212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  58.69 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  64.53 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  66.01 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  66.01 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  61.76 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  67.16 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  56.59 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  57.07 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  68.95 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  56.59 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  58.49 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  54.41 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  62.56 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  56.78 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  53.43 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  53.66 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  51.71 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  54.21 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  56.28 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  49.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  57.69 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  58.73 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  54.9 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  54.55 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  54.63 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  58.33 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  56.54 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  55.17 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.1 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  57.29 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 514 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  45.85 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.93 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  51.44 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  45.32 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  45.32 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  47.55 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  45.32 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.35 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  45.63 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  37.84 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  40.98 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  40.57 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  40.57 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  40.57 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>