More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0324 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0862  cytidylate kinase  83.19 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316636  hitchhiker  0.00695243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3142  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00253738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1668  cytidylate kinase  59.55 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.41 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 527 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.78 
 
 		 528 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.67 
 
 		 517 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.89 
 
 		 483 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.2 
 
 		 526 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.33 
 
 		 480 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0688  cytidylate kinase  45.36 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.68 
 
 		 516 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.34 
 
 		 488 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.68 
 
 		 516 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.07 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 539 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 534 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.54 
 
 		 529 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  36.79 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  35.14 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>