More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0688 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0688  cytidylate kinase  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  45.23 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.56 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 252 aa  161  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0862  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316636  hitchhiker  0.00695243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.5 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.61 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.56 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.64 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.8 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3142  cytidylate kinase  46.94 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00253738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  45.36 
 
 		 244 aa  154  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.61 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  38.38 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  39 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  40.41 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.97 
 
 		 230 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.84 
 
 		 226 aa  151  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  38.58 
 
 		 233 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.22 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.5 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.39 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  41 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.31 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  42 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  39.8 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.31 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.31 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  41.45 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  45.6 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  39 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.02 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  41.75 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.84 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 229 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  39.7 
 
 		 220 aa  144  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.24 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  40.41 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  39 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  41.45 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  39 
 
 		 227 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  40.21 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.06 
 
 		 511 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  37.76 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.06 
 
 		 511 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 230 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  39.69 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  43.15 
 
 		 223 aa  140  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.62 
 
 		 529 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>