More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4053 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  100 
 
 		 237 aa  454  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  56.17 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  56.17 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  56.17 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  55.02 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  49.13 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  57.78 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  51.54 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.41 
 
 		 527 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  50.44 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  51.98 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  47.32 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.3 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 		 511 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 		 511 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.92 
 
 		 526 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.1 
 
 		 529 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.48 
 
 		 514 aa  164  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.16 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  51.3 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.47 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.81 
 
 		 534 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.27 
 
 		 528 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  46.67 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  35.91 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  44.74 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  53.07 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  40 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  45.74 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 539 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.83 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.18 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 517 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.85 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  40.79 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  38.77 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  46.22 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.53 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  44.54 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  44.69 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  38.94 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  38.94 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.53 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 516 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 516 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  40.57 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  39.56 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  39.65 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.91 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.52 
 
 		 675 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.95 
 
 		 510 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  36.24 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 		 488 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>