More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1045 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  78.6 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  78.6 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  56.48 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  56.02 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  55.56 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  53.7 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  51.83 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  49.08 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  51.38 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  48.18 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.2 
 
 		 534 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.39 
 
 		 528 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  48.13 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.13 
 
 		 480 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 539 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.16 
 
 		 527 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.26 
 
 		 516 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  45.24 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.26 
 
 		 516 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.4 
 
 		 511 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.4 
 
 		 511 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.83 
 
 		 526 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.36 
 
 		 529 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.93 
 
 		 517 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 488 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.23 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.93 
 
 		 483 aa  161  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  44.09 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.98 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.38 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.28 
 
 		 509 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  37.98 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  39.32 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  40 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.07 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  37.38 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  39.44 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.04 
 
 		 675 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.26 
 
 		 510 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>