More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0903 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  61.61 
 
 		 549 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  99.46 
 
 		 554 aa  1098    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  70.55 
 
 		 565 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 554 aa  1105    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  68.25 
 
 		 558 aa  699    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  65.88 
 
 		 591 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  63.8 
 
 		 547 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  70.75 
 
 		 557 aa  759    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  68.9 
 
 		 559 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  59.6 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  61.68 
 
 		 573 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  51.6 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  52.28 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  50.36 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  53.06 
 
 		 569 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  49.21 
 
 		 589 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  47.08 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  48.18 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  48.48 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  47.65 
 
 		 557 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  48.13 
 
 		 549 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  48.31 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  48.31 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  47.34 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 549 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  49.01 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  48.18 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  44.75 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3968  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.039947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0730  DNA repair protein RecN  48.47 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.937093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  43.54 
 
 		 563 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  47.26 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  43.38 
 
 		 567 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  40.07 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  42.91 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  40.07 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  40.07 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  39.89 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  41.52 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  39.89 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  39.71 
 
 		 553 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  39.78 
 
 		 553 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  39.89 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  39.86 
 
 		 554 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  39.02 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  39.02 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  39.02 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  44.17 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  39.71 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  39.02 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  39.57 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  38.48 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  38.92 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  40.97 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  40.79 
 
 		 559 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  38.96 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  39.57 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  38.96 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  38.84 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  39.57 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  38.66 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  39.57 
 
 		 553 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  39.57 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  38.73 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  41.25 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  38.48 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  39.42 
 
 		 553 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  38.81 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  36.74 
 
 		 565 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  41.59 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  37.86 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  41.86 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  39.2 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  38.29 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  37.55 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  38.66 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  42.17 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  41.25 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  44.28 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  38.74 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  38.2 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  38.41 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  40.22 
 
 		 559 aa  363  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  38.22 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 554 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  38.77 
 
 		 555 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  40.9 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  38.02 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  38.21 
 
 		 561 aa  352  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  37.61 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>