More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01130 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  59.64 
 
 		 552 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  59.1 
 
 		 552 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  59.1 
 
 		 552 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  59.1 
 
 		 552 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  59.82 
 
 		 553 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  96.75 
 
 		 554 aa  1081    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  58.77 
 
 		 553 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  100 
 
 		 554 aa  1135    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  59.1 
 
 		 552 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  58.98 
 
 		 552 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  59.17 
 
 		 552 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  58.26 
 
 		 552 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  81.23 
 
 		 554 aa  917    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  72.43 
 
 		 565 aa  829    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  58.98 
 
 		 552 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  59.1 
 
 		 552 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  57.17 
 
 		 553 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  60.8 
 
 		 554 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  59.03 
 
 		 554 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  57.99 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  618  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  56.42 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  56.42 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  56.24 
 
 		 553 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  56.24 
 
 		 553 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  56.24 
 
 		 553 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  56.24 
 
 		 553 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  56.24 
 
 		 553 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  56.24 
 
 		 553 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  56.06 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  55.88 
 
 		 553 aa  611  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  55.88 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  54.79 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  54.79 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  54.79 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  54.79 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  54.94 
 
 		 558 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  54.25 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  53.16 
 
 		 553 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  52.8 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  49.46 
 
 		 557 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  50 
 
 		 561 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  47.76 
 
 		 561 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  49.28 
 
 		 558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  49.09 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  47.93 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  46.84 
 
 		 559 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  47.75 
 
 		 557 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  47.22 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  48.01 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  47.39 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  47.21 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  47.66 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  46.31 
 
 		 557 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  46.49 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  46.49 
 
 		 557 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  42.96 
 
 		 567 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.75 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  44.32 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  42.47 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  42.75 
 
 		 559 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  41.56 
 
 		 608 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  41.56 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  42.37 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  42.65 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  42.68 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  42.32 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  42.25 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  41.92 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  42.01 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  41.98 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 		 563 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  40.79 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  41.67 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  40.93 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  41.26 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  40.97 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.83 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  41.55 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  41.26 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  41.37 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  41.26 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  41.07 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.25 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>