More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_4057 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.6 
 
 
251 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.6 
 
 
251 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 
252 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 
251 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 
251 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  98.41 
 
 
251 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  93.6 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  87.15 
 
 
251 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  86.35 
 
 
251 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  87.24 
 
 
252 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  85.54 
 
 
251 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  86.83 
 
 
252 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  85.54 
 
 
251 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  85.14 
 
 
251 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  86.53 
 
 
254 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  85.37 
 
 
250 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  81.89 
 
 
253 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  79.01 
 
 
247 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  78.19 
 
 
247 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  76.54 
 
 
247 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  78.19 
 
 
247 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  73.66 
 
 
247 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  69.71 
 
 
248 aa  340  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  68.57 
 
 
270 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  64.61 
 
 
249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  62.7 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  62.86 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  64.75 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  63.22 
 
 
248 aa  298  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  61.48 
 
 
253 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  60 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  58.16 
 
 
241 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  61.34 
 
 
243 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  60.91 
 
 
239 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  56.9 
 
 
241 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  61.34 
 
 
252 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.92 
 
 
271 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  59.92 
 
 
251 aa  271  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  56.61 
 
 
243 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  60 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  59.26 
 
 
239 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
241 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
249 aa  263  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  56.73 
 
 
248 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  58.55 
 
 
231 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  56.3 
 
 
249 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  53.75 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  52.63 
 
 
247 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  56.33 
 
 
243 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
247 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.23 
 
 
247 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.23 
 
 
247 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
247 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.42 
 
 
247 aa  244  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.42 
 
 
247 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.89 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  49.37 
 
 
233 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  53.33 
 
 
239 aa  234  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.45 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.04 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
235 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.05 
 
 
234 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.83 
 
 
264 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  53.36 
 
 
244 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.25 
 
 
239 aa  232  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  51.68 
 
 
233 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  49.58 
 
 
237 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.72 
 
 
235 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  51.05 
 
 
234 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  52.72 
 
 
234 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.21 
 
 
238 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 
234 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.16 
 
 
235 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.16 
 
 
234 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  46.94 
 
 
247 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.42 
 
 
239 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.04 
 
 
236 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.75 
 
 
237 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  50.21 
 
 
233 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.32 
 
 
237 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.31 
 
 
247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.31 
 
 
247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.9 
 
 
236 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  46.31 
 
 
247 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
253 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.24 
 
 
258 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  47.7 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 
237 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  50.62 
 
 
241 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.42 
 
 
235 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
234 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.84 
 
 
234 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.16 
 
 
238 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>