More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5682 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  62.39 
 
 		 235 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  63.25 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  63.36 
 
 		 235 aa  294  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  68.1 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  64.5 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  64.22 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  64.53 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  64.5 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  61.44 
 
 		 256 aa  288  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  64.07 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  62.82 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  62.77 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  62.23 
 
 		 235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  62.82 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 235 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  60.09 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  56.84 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  60.52 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  59.32 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.94 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  58.37 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.08 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  55.98 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  55.08 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  57.51 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  58.8 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.8 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  56.41 
 
 		 238 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  60.94 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.08 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  56.41 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  54.24 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  59.32 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  60.09 
 
 		 235 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 238 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  59.05 
 
 		 233 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 238 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  55.98 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2041  ABC transporter related  51.19 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  57.69 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.09 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  53.62 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 234 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  54.7 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  58.8 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  54.7 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.52 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.27 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  61.8 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.56 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  56.65 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  61.37 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  57.2 
 
 		 236 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  58.72 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  58.72 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  58.72 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  61.8 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  52.99 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  56.65 
 
 		 241 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  52.23 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.7 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  57.87 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  58.82 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  55.13 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.56 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  53.75 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  58.37 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  55.82 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  53.59 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  53.33 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>