More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0575 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  78.93 
 
 		 243 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  69.07 
 
 		 255 aa  329  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  63.52 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  65.68 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  62.29 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  61.16 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  59.02 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  60.5 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  64.63 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  57.61 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  57.38 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  56.5 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  58.16 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.2 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  58.02 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  57.61 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  57.2 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.12 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  56.22 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  54.88 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  58.58 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.42 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  60.17 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  55.02 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  56.73 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  56.73 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  55.37 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  55.37 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.73 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  53.11 
 
 		 243 aa  261  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  61.02 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  60.25 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  52.92 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.49 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.63 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.1 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.28 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.26 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.55 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.23 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.72 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  52.74 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.64 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.55 
 
 		 239 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  49.79 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  44.87 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.32 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  48.94 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  48.73 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.7 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  47.88 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  48.51 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  53.53 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.95 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  50.64 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.5 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.5 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  48.31 
 
 		 265 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  47.08 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  47.08 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.42 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  51.04 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>