More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3818 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  58.9 
 
 
239 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
235 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  54.13 
 
 
247 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
241 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  52.85 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.91 
 
 
234 aa  251  6e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.06 
 
 
236 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.94 
 
 
239 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.95 
 
 
236 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.97 
 
 
247 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  48.1 
 
 
260 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  49.17 
 
 
251 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  51.65 
 
 
241 aa  242  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
249 aa  241  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.08 
 
 
237 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
237 aa  241  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.26 
 
 
235 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
237 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  50.41 
 
 
243 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.09 
 
 
244 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  49.79 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  49.58 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  48.95 
 
 
246 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.31 
 
 
235 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.79 
 
 
235 aa  234  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
236 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  49.79 
 
 
234 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  44.77 
 
 
237 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.66 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  48.95 
 
 
240 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
234 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.64 
 
 
236 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.23 
 
 
233 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  44.3 
 
 
238 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  47.06 
 
 
232 aa  228  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  48.1 
 
 
237 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.51 
 
 
235 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  47.88 
 
 
248 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.84 
 
 
237 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.75 
 
 
242 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  45.76 
 
 
242 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  45.76 
 
 
242 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
235 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  51.05 
 
 
243 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  44.73 
 
 
238 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 
258 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
233 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  45.96 
 
 
237 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  47.88 
 
 
249 aa  225  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  47.46 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  47.68 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.96 
 
 
235 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.15 
 
 
236 aa  224  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.03 
 
 
233 aa  224  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  48.94 
 
 
264 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  44.68 
 
 
233 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  47.66 
 
 
234 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  44.26 
 
 
233 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  48.09 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  45.99 
 
 
242 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 
249 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  47.26 
 
 
236 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  45.99 
 
 
238 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  44.63 
 
 
245 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  46.22 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  47.66 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  46.81 
 
 
238 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 
241 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.06 
 
 
247 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
234 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.83 
 
 
234 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.19 
 
 
233 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
236 aa  223  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.08 
 
 
258 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  48.32 
 
 
252 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.26 
 
 
233 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  48.52 
 
 
246 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  43.8 
 
 
244 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.99 
 
 
259 aa  222  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  47.7 
 
 
270 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
238 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  46.64 
 
 
238 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  47.5 
 
 
243 aa  221  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  47.46 
 
 
237 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
234 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  46.81 
 
 
437 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  43.83 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>