More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1261 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  473  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  63.09 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  61.8 
 
 		 235 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.52 
 
 		 235 aa  291  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.52 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.94 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  58.37 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 233 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  58.37 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  56.65 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  58.37 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  57.51 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 234 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  55.56 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  55.13 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  57.45 
 
 		 239 aa  276  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  275  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.22 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  56.84 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  57.08 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  57.69 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  57.02 
 
 		 239 aa  274  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  56.22 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  58.8 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  57.94 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  58.37 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.94 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  54.94 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  56.22 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  55.74 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  55.79 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 237 aa  267  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  266  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  57.56 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  54.94 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.51 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.71 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.51 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.79 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  56.54 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  54.51 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  55.36 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  55.79 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.56 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>