More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2236 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  470  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  73.93 
 
 
239 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  67.09 
 
 
235 aa  334  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  65.81 
 
 
234 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  66.24 
 
 
235 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.53 
 
 
234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  63.95 
 
 
235 aa  314  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  64.96 
 
 
233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  62.23 
 
 
235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  65.24 
 
 
259 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  63.95 
 
 
233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  62.23 
 
 
235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  61.97 
 
 
236 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.68 
 
 
236 aa  300  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  61.37 
 
 
237 aa  299  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  60.94 
 
 
239 aa  298  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  61.8 
 
 
237 aa  298  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  62.23 
 
 
233 aa  296  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  60.09 
 
 
236 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  58.8 
 
 
236 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  61.37 
 
 
236 aa  295  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  58.97 
 
 
237 aa  294  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  58.72 
 
 
237 aa  292  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  60.09 
 
 
239 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  60.09 
 
 
237 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  58.55 
 
 
235 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  58.12 
 
 
256 aa  288  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 
237 aa  288  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  60.09 
 
 
238 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  58.12 
 
 
243 aa  286  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  58.82 
 
 
247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  58.37 
 
 
249 aa  284  7e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  58.37 
 
 
235 aa  284  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.69 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  55.79 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  57.51 
 
 
234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.51 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
247 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  58.97 
 
 
234 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 
247 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  57.26 
 
 
234 aa  280  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.36 
 
 
238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.36 
 
 
238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.79 
 
 
238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  57.08 
 
 
237 aa  278  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  56.65 
 
 
238 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  58.12 
 
 
238 aa  278  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.46 
 
 
247 aa  278  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  56.22 
 
 
233 aa  278  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  61.11 
 
 
237 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  52.99 
 
 
233 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.98 
 
 
235 aa  275  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.08 
 
 
236 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  53.85 
 
 
233 aa  275  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
256 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
234 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  53.42 
 
 
233 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
233 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  55.79 
 
 
244 aa  274  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
236 aa  274  7e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  54.94 
 
 
265 aa  274  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.79 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.99 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.71 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  53.22 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  55.88 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.27 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  55.74 
 
 
240 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
238 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
245 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  55.74 
 
 
251 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  56.3 
 
 
247 aa  272  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  54.51 
 
 
264 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  54.94 
 
 
238 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  52.36 
 
 
238 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.36 
 
 
236 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  52.36 
 
 
238 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  55.79 
 
 
239 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  51.71 
 
 
233 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  54.27 
 
 
236 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>