More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0356 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  59.66 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 235 aa  274  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  55.56 
 
 		 235 aa  271  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  56.84 
 
 		 237 aa  268  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.51 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  56.65 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.85 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 235 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  55.36 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.51 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.08 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.22 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 		 247 aa  255  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 237 aa  255  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.94 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  55.36 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  57.02 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  57.33 
 
 		 237 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  53.94 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  53.59 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.85 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.7 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.36 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  53.97 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  54.89 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  54.62 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.5 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  52.14 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.22 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.99 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  53.97 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  52.54 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  54.94 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  248  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  50.85 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  52.36 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.94 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  50.43 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.42 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.36 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.36 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  54.85 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  54.81 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  52.56 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.49 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.45 
 
 		 237 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.36 
 
 		 236 aa  245  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  53.22 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  53.65 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  52.14 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.28 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  53.02 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>