More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2365 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  58.97 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  58.12 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.26 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 245 aa  257  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  55.13 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.14 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.69 
 
 		 235 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  56.41 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.99 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  55.65 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  55.13 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  55.42 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 234 aa  246  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.85 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.12 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  52.56 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  57.26 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  52.74 
 
 		 239 aa  244  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  54.27 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  54.04 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  52.77 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.28 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.7 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.56 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  53.81 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.91 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  53.81 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  53.81 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.28 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  54.27 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  51.71 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  51.91 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  55.13 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  51.71 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.85 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  51.28 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  51.91 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.56 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  55.98 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  52.56 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.91 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  51.71 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  53.85 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.34 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  52.56 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.14 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  53.85 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  51.49 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.56 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.99 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  54.51 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.71 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  51.28 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  54.91 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  51.28 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  53.85 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.15 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  52.56 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.12 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50.64 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  51.71 
 
 		 437 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>