More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1069 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  66.67 
 
 		 234 aa  328  6e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  65 
 
 		 234 aa  314  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  59.17 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  59.17 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  57.74 
 
 		 236 aa  291  7e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.9 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  54.81 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.58 
 
 		 234 aa  266  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  56.07 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  58.58 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  54.81 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  56.25 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.32 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.39 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  54.58 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.42 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  54.17 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  56.07 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  53.75 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  56.07 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  55.65 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  55.42 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  53.14 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.65 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.97 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  53.56 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  52.08 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.88 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.33 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  53.33 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  51.67 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  53.56 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  54.39 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.25 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.63 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.25 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.67 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  51.25 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  55.79 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  52.5 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  53.56 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  53.33 
 
 		 233 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  56.9 
 
 		 234 aa  244  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 237 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  54.17 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  51.25 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.3 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  54.81 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  52.08 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  52.28 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  53.94 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.23 
 
 		 247 aa  241  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  47.95 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>