More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0345 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  60 
 
 		 259 aa  296  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.94 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  64.22 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  62.93 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  65.38 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  62.07 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  61.54 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  59.75 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  60.85 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  60.85 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2041  ABC transporter related  56.45 
 
 		 388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  60.52 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  59.66 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  55.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  55.98 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.56 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  56.65 
 
 		 234 aa  274  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  57.26 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  59.92 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  57.51 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  58.19 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  60.68 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  60.68 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  56.36 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.83 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.08 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  55.13 
 
 		 237 aa  268  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.76 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  59.83 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.76 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  56.65 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  59.66 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  54.7 
 
 		 236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  58.97 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.42 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  57.76 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  57.51 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  57.76 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 234 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  56.47 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  57.33 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  56.41 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  56.9 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  57.63 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  57.63 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  57.63 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  59.23 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  57.94 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  55.36 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  59.48 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  54.27 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  52.99 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  51.71 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  56.22 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 234 aa  257  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.04 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  58.19 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  56.02 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.69 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>