More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4412 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  100 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  98.74 
 
 
238 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  84.03 
 
 
238 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  60.09 
 
 
236 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  54.62 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
234 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 
234 aa  284  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.94 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  57.26 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  59.23 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  59.66 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  58.8 
 
 
235 aa  280  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  53.36 
 
 
238 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  57.38 
 
 
239 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  53.36 
 
 
238 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.27 
 
 
235 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  55.36 
 
 
234 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  52.94 
 
 
238 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  53.36 
 
 
238 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  53.36 
 
 
238 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  52.94 
 
 
238 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  56.22 
 
 
234 aa  279  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  52.94 
 
 
238 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
235 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.52 
 
 
238 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  52.94 
 
 
238 aa  277  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  56.54 
 
 
239 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
234 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  54.2 
 
 
238 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.27 
 
 
236 aa  275  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  54.7 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  57.08 
 
 
238 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.27 
 
 
237 aa  274  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  53.78 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 
244 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  53.42 
 
 
236 aa  270  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
237 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  60.68 
 
 
242 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
256 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  54.27 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.62 
 
 
239 aa  268  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.52 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.52 
 
 
238 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  53.42 
 
 
236 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  54.81 
 
 
248 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
237 aa  266  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  56.96 
 
 
237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  55.51 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  51.68 
 
 
238 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  54.27 
 
 
233 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  54.27 
 
 
242 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  54.08 
 
 
234 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.84 
 
 
235 aa  263  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  55.27 
 
 
237 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  55.27 
 
 
237 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  57.69 
 
 
237 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.79 
 
 
234 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  53.65 
 
 
239 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  55.56 
 
 
237 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  55.36 
 
 
245 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  51.26 
 
 
238 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
233 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  54.7 
 
 
237 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
235 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.36 
 
 
236 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.93 
 
 
237 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.14 
 
 
265 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  51.71 
 
 
264 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  58.62 
 
 
237 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  54.08 
 
 
235 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  57.81 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  55.13 
 
 
235 aa  258  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
234 aa  258  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.51 
 
 
234 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  54.7 
 
 
234 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
233 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  51.69 
 
 
239 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 
237 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  54.94 
 
 
234 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
236 aa  256  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.22 
 
 
235 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
234 aa  256  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  51.71 
 
 
242 aa  255  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  51.71 
 
 
242 aa  255  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  55.36 
 
 
233 aa  255  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  52.14 
 
 
242 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>