More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2754 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  80.17 
 
 		 238 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  83.19 
 
 		 238 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  73.62 
 
 		 236 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  71.01 
 
 		 237 aa  347  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  69.66 
 
 		 239 aa  338  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  60.68 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  58.12 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  58.37 
 
 		 235 aa  278  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  58.37 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  57.94 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  58.47 
 
 		 238 aa  274  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  56.6 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  58.37 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  60.09 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.98 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  56.84 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  57.94 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  58.8 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  55.36 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.31 
 
 		 236 aa  268  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.98 
 
 		 239 aa  267  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  55.98 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.13 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.98 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 237 aa  264  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  55.56 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  55.56 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  56.84 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  55.56 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  55.56 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  54.7 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.36 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  55.13 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.93 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  57.69 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.94 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.56 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.39 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  54.27 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  55.36 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  53.19 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  57.94 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  54.17 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  51.93 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  55.04 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  53.11 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.27 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  55.88 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  54.08 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.72 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  55.04 
 
 		 247 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>