More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1482 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  77.78 
 
 		 234 aa  358  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  78.21 
 
 		 234 aa  353  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  74.36 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  73.08 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  64.1 
 
 		 237 aa  311  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  61.54 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 259 aa  300  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  61.97 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  62.98 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 235 aa  296  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  59.23 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  60.94 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  60.52 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 235 aa  295  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  58.97 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  59.66 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  57.94 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  59.23 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  58.12 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  61.37 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.12 
 
 		 239 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.51 
 
 		 236 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  55.36 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  55.79 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  58.37 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  58.8 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  56.3 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  58.8 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  56.22 
 
 		 237 aa  274  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.27 
 
 		 237 aa  274  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  56.65 
 
 		 239 aa  274  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  60.09 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  57.94 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  55.79 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.08 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  58.8 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  54.94 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  55.04 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  57.94 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  54.51 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  57.51 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  54.2 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  58.8 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.51 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  60.09 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 256 aa  267  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  55.56 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  57.51 
 
 		 247 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  57.51 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  55.36 
 
 		 260 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  58.8 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  57.94 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 238 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  56.22 
 
 		 238 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 238 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.51 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  57.26 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  57.08 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.52 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  56.65 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>